早上起床小腹疼痛，小便后症状消失可能是生理性因素引起的，也有可能是膀胱炎、尿道炎等病理性因素导致的。患者需要根据病因对症治疗。

一、生理性因素

如果晚上睡觉前喝水过多或者吃了太多的食物，容易增加肾脏负担，从而出现上述情况。建议平时要养成良好的生活习惯，不要暴饮暴食，睡前避免喝太多的水。

二、病理性因素

1.膀胱炎：膀胱炎是由细菌感染引起的炎症反应，由于炎症刺激会导致排尿异常、下腹部坠胀等症状。可以在医生指导下服用盐酸左氧氟沙星胶囊、诺氟沙星片等药物进行治疗。

2.尿道炎：尿道炎是指由淋球菌或非淋球菌等病原体引起的急慢性尿道炎症，主要表现为尿频、尿痛、尿道刺痒等症状。可以遵医嘱使用阿奇霉素分散片、头孢克肟颗粒等药物来改善病情。

除此之外，还可能与肾结石有关，建议及时就医检查并治疗。