男性小便刺痛且有黄色脓液排出通常是由于尿路感染引起的，如淋病奈瑟菌、沙眼衣原体等性传播疾病所致。

尿路感染是由致病微生物上行至泌尿系统引起的炎症反应，可导致尿频、尿急、尿痛及尿道口红肿、瘙痒等症状。而淋病奈瑟菌、沙眼衣原体等可通过性接触传播，在机体免疫力下降时易诱发尿路感染，出现上述不适症状。患者可在医生指导下使用头孢曲松钠、盐酸多西环素进行抗感染治疗。

若患者存在长期憋尿或饮水量减少等不良生活习惯，则可能使细菌滋生，引起尿路感染，从而引发尿道灼热感、排尿困难等不适症状。此时需要增加水分摄入量以促进排泄，并保持下体清洁干燥。

针对男性小便刺痛伴有黄色脓液的症状，应避免自行服用抗生素药物进行治疗，以免影响疾病的诊断与鉴别诊断。同时还要注意个人卫生，勤换内裤，穿宽松透气的裤子，以减少摩擦和刺激。