疏通输卵管后肚子疼可能是术后并发症如感染引起的，需要及时处理以防止进一步的生殖系统损害。

输卵管疏通术是一种侵入性操作，会破坏输卵管内的正常菌群平衡，增加细菌感染的风险。如果术后未严格遵守医嘱进行抗生素治疗或个人卫生习惯不佳，可能导致细菌上行感染至盆腔，引起腹痛、发热、腰酸背痛等不适症状。因此，患者应密切关注腹痛情况，必要时需返院复查。

若疼痛持续时间较长且伴有阴道异常出血，则可能与输卵管损伤有关，此时要高度警惕并发输卵管妊娠破裂的可能性。

在进行输卵管疏通手术后，应注意休息，避免剧烈运动和过度劳累，以免加重腹部不适。同时，保持外阴清洁干燥，避免感染风险。