有效药物选择：生殖道沙眼衣原体感染的有效药物为头孢曲松。

头孢曲松是一种广谱抗生素，能够有效地抑制革兰氏阴性菌的生长，包括沙眼衣原体。

其作用机制主要是通过干扰细菌细胞壁的合成过程，导致细菌破裂、死亡，从而达到杀菌的目的。由于沙眼衣原体属于革兰氏阴性菌，所以头孢曲松对于此病原体有较好的抗菌效果。

除了头孢曲松外，四环素类抗生素如多西环素或阿奇霉素也是治疗生殖道沙眼衣原体感染的有效药物。这些药物能特异性地与细菌核糖体结合，阻止蛋白质合成，进而杀死细菌。

在使用头孢曲松或其他抗生素治疗前，应确保无过敏史，并按医嘱完成整个疗程以防止耐药性的产生。同时，患者应注意个人卫生，避免过度使用抗生素以防不必要的副作用发生。