大便时肛门疼痛且大便不成形可以考虑采取中药调理、肠道微生物群调节、镇痛药物、肛门括约肌功能锻炼、生物反馈疗法等方法进行治疗。如果症状持续或加重，建议及时就医以确定病因并获得适当治疗。

1.中药调理

通过服用具有清热解毒、利湿止血功效的中草药来改善症状。适用于因湿热下注引起的肛门疼痛及大便不畅的情况。

2.肠道微生物群调节

通过口服益生菌制剂或调整饮食结构来恢复肠道微生态平衡。适合因肠道菌群失调导致消化吸收功能紊乱而引起的相关问题。

3.镇痛药物

使用非甾体抗炎药如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等减轻肛门区域的不适感。短期用于缓解急性发作期的剧烈疼痛。不宜长期使用以免产生依赖性。

4.肛门括约肌功能锻炼

采用提肛运动增强肛门括约肌力量和稳定性以减少疼痛发生。每日定时定量完成一定数量的提肛动作，可有效预防和改善相关症状。

5.生物反馈疗法

利用专业设备监测肌肉活动，并提供放松技巧训练患者控制紧张度。针对存在功能性排便障碍者，旨在通过学习识别及控制异常盆底肌收缩模式来改善情况。

在诊断明确后，应避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒、生姜等，以减少对肛门黏膜的刺激。同时，保持良好的排便习惯，避免久坐久站，也有助于缓解症状。