脚趾甲长两层可能是真菌感染、外伤导致甲床损伤、遗传因素、维生素缺乏、糖尿病等病因导致的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的诊断和治疗。

1.真菌感染

当指甲被真菌侵袭时，会导致角质层增厚，从而出现多层的情况。患者可在医生指导下使用抗真菌药膏进行局部涂抹，如特比萘芬乳膏、酮康唑软膏等。

2.外伤导致甲床损伤

由于受到外界撞击或者磕碰等原因引起甲床部位受损，在愈合过程中可能会形成多个薄层。轻微的甲床损伤通常不需要特殊处理，注意保持患处清洁干燥即可。若伴有疼痛等症状，则需遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠肠溶片等药物缓解不适。

3.遗传因素

如果患者的父母存在类似的指甲生长模式，那么他可能从父母那里继承了这种特征。这种情况通常不需要担心，也不需要采取任何治疗措施。

4.维生素缺乏

体内缺乏维生素可能导致指甲脆弱易碎，进而出现分层现象。补充维生素B群和E可以改善指甲健康状况，例如复合维生素制剂或食物来源如全谷类食品、坚果和种子。

5.糖尿病

高血糖状态会引起微血管病变，影响指甲组织的血液供应和营养供应，导致指甲变脆、易裂开。控制好血糖水平是关键，可通过口服降糖药如二甲双胍、格列齐特等降低血糖浓度。

针对足部真菌感染引起的指甲异常，建议定期到医院进行真菌培养等相关检查，以监测病情变化并调整治疗方案。