做了肛瘘手术后内口感染可能是正常现象，也有可能是不注意卫生、伤口愈合不良等原因引起的。患者需要根据病因进行针对性治疗。

1.正常现象：如果在做肛瘘手术时没有将内口完全清除干净，在术后可能会出现局部感染的情况。此时属于正常的生理现象，一般不需要过分担心，也不用特殊治疗，可以通过温水坐浴的方式进行改善，并且还要做好个人的卫生工作。

2.不注意卫生：如果没有定期更换药物或者经常用手抓挠患处，容易导致细菌滋生，从而诱发感染的情况。建议患者要保持局部清洁干燥，避免沾水，以免加重病情。同时也要勤换洗内衣裤，穿宽松纯棉的衣物。

3.伤口愈合不良：如果患者的体质比较差，而且身体免疫力低下，会导致伤口愈合不良，也会引起上述情况。可以遵医嘱使用碘伏溶液、过氧化氢溶液等药物进行消毒处理，也可以通过红外线照射等方式促进血液循环，有利于伤口愈合。

除此之外，还可能与饮食不当、护理不当等因素有关，建议及时就医诊断治疗。