肠镜检查是临床上比较常见的一种检查方式，可以用于检查结肠、直肠等部位是否存在病变。肠镜不能检查的部位主要包括肛门、阑尾、小肠等。

1、肛门：由于肠镜检查时需要将肠镜从肛门进入肠道内，因此对于有肛周脓肿或痔疮的患者，一般不建议进行肠镜检查，以免导致病情加重；

2、阑尾：如果患者存在阑尾炎，则不建议进行肠镜检查，因为此时进行肠镜检查可能会导致炎症扩散，不利于病情恢复；

3、小肠：由于小肠位于腹腔深处，而且长度较长，所以进行肠镜检查时难度较大。如果患者存在小肠梗阻的情况，则不建议进行肠镜检查，以免导致病情加重；

4、其他部位：如十二指肠和回盲瓣等部位。此外，对于孕妇以及存在严重心肺疾病的患者也不建议进行肠镜检查。另外，在做肠镜前需要先进行全麻，而全麻会对身体造成一定的影响，所以对于患有严重心脑血管疾病的患者也不建议进行此项检查。

在做完肠镜后需要注意多休息，并且短时间内不可以进食，以免出现不良反应。