长了卵巢囊肿有可能会引起头疼，因为长卵巢囊肿有可能会导致内分泌紊乱，从而引起头疼等不适症状，但头疼也可能是其他因素引起，比如感冒或者神经性头痛。

1、内分泌紊乱：卵巢囊肿是一种卵巢细胞异常增生而形成的囊性结构，如果体内的雌激素分泌过多，有可能会导致内分泌紊乱，从而引起头疼的症状。此时可以配合医生口服布洛芬缓释胶囊进行缓解，能够起到抗炎止痛的作用;

2、感冒：如果在生理期间没有做好保暖工作，或者受到细菌感染引发感冒，也有可能会诱发头疼的现象，并且会出现鼻塞和流鼻涕等症状。如果头疼的情况较为严重，可以配合医生服用布洛芬缓释胶囊等药物进行治疗，能够起到抗炎镇痛的作用，如果是细菌感染导致的感冒，还可以辅助使用阿莫西林胶囊等抗生素进行治疗;

3、神经性头痛：如果长时间的精神过度紧张以及生活压力过大，有可能会诱发神经性头痛，导致头部出现闷痛或者是压迫感，并且还会放射到耳后。如果头疼比较严重，可以遵医嘱服用双氯芬酸钠缓释片等药物进行治疗，能够起到镇痛的作用;

4、其他因素：比如脑部肿瘤或者是脑梗死、脑出血等疾病，容易导致颅内压升高，也有可能会造成头疼的症状。此时可以做脑部CT检查，明确病因后再进行治疗。

建议患者及时前往医院的妇科就诊，完善B超、血常规等检查，明确诊断后采取针对性治疗，以免延误病情。治疗期间需要注意多休息，并且还要注意加强营养补充，多吃一些富含蛋白质或维生素的食物，同时还要注意保持良好的心态。