两次检查HPV分型不一样，可能是体质原因导致，也可能是检测试剂不同、检查方法不正确、检查人群不同等原因导致，建议根据具体情况进行处理。

1、体质原因：HPV分型检查需要根据感染上皮组织的类型判断，若体内感染上皮组织的类型为HPV1、HPV2、HPV3、HPV4、HPV5等，分型并不一样，可能会出现假阳性的情况。另外，若女性机体免疫能力较低，对病原菌的抵抗能力也会下降，继而导致HPV分型不一样;

2、检测试剂不同：进行HPV分型检查时，需要使用专门的采样器进行采集宫颈分泌物，并将其放置于特定的试剂盒中进行检测。若检测试剂不同，检测结果就会存在一定的差异，可能会出现两次检查HPV分型不一样的情况;

3、检查方法不正确：如果进行HPV分型检查时没有按照正确的方法进行检测，可能会因检测试剂盒不标准等原因导致检查结果出现偏差，继而造成两次检查HPV分型不一样;

4、检查人群不同：进行HPV分型检查的人群比较多，如果女性仅进行一次或两次HPV分型检查，就可能会因此出现两次检查HPV分型不一样的现象。

HPV感染在临床上比较常见，大部分患者在早期没有明显症状，随着病情加重可能会出现阴部瘙痒、异味等不适。建议女性定期进行妇科检查，完善HPV筛查，有利于降低宫颈癌的发病率。