精子畸形率降低96%，属于异常情况，可能由不良生活习惯、环境因素、精索静脉曲张、内分泌异常等原因导致。建议就医明确具体原因，遵医嘱进行针对性处理。

1、不良生活习惯：如大量吸烟、酗酒、熬夜等不良生活习惯，可能导致精子畸形率降低，建议尽早戒烟戒酒，避免熬夜;

2、环境因素：长期接触重金属、有机磷农药等化学物质，或长期在不良环境下工作，可能会导致精子畸形率降低，建议脱离不良环境，注意休息;

3、精索静脉曲张：通常与先天发育异常、遗传等因素有关，可引起睾丸局部血液循环障碍，影响睾丸生成精子的数量、质量，可能导致精子畸形率降低，患者可遵医嘱使用迈之灵片、地奥司明片等药物进行治疗;

4、内分泌异常：患者出现甲状腺功能亢进症时，体内甲状腺激素分泌过多，可能会影响到睾丸的生精功能，引起精子畸形率降低。患者可在医生指导下使用甲巯咪唑片、丙硫氧嘧啶片等药物进行治疗。

此外，还可能与睾丸炎、附睾炎等疾病有关，睾丸炎患者多由细菌感染引起，由于病原体侵袭感染睾丸，所以可能导致精子畸形率降低，患者可遵医嘱使用头孢克肟颗粒、盐酸左氧氟沙星片等药物治疗。附睾炎患者多由大肠埃希菌等病原体感染引起，由于病原体侵袭附睾引起炎症，所以可能导致精子畸形率降低，患者可遵医嘱使用头孢拉定胶囊、头孢氨苄颗粒等药物进行治疗。