肛门指检后特别疼可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行缓解。建议患者及时就医，在医生的指导下选择合适的治疗方法。

一、一般治疗

1.饮食调整：在做完肛门指检之后，如果局部有疼痛症状，并没有伴随其他不适症状，可以适当吃新鲜水果和蔬菜，比如香蕉、火龙果等，能够补充身体所需要的维生素C，促进胃肠道蠕动，从而改善便秘的情况，有利于病情恢复。

2.温水坐浴：在做肛门指检时，可能会对肛周黏膜造成刺激，出现轻微肿胀以及疼痛等症状。此时可以用温热的毛巾或热水袋热敷，促进血液循环，减轻肿胀情况。

二、药物治疗

如果通过上述方法无法得到改善，则可以在医生的指导下服用布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等非甾体类抗炎药进行止痛治疗，同时还可以外用马应龙麝香痔疮膏、复方角菜酸酯乳膏等药物辅助改善。

除此之外，还要注意平时护理、手术治疗等方式进行处理。若期间出现明显不适，还需及时就诊。