婴儿病毒性结膜炎可以使用阿昔洛韦、更昔洛韦、利巴韦林或干扰素等眼药水进行治疗。由于婴儿的免疫系统发育不完善，对药物的耐受性也有所不同，因此，在使用这些药物之前，应确保由合格的医疗专业人员进行评估和指导。

1.阿昔洛韦

阿昔洛韦适用于治疗由疱疹病毒感染引起的婴儿病毒性结膜炎。该药物具有抑制病毒DNA合成的作用。

长期使用时需监测肾功能，避免与其他耳毒性药物同时使用。

2.更昔洛韦

更昔洛韦可用于治疗巨球蛋白血症、慢性活动性肝炎等疾病所诱发的免疫缺陷患者出现的感染。本品能特异性地与脱氧鸟苷酸掺入至病毒DNA中，从而引起DNA链延长终止。 既往有严重骨髓抑制者慎用。

3.利巴韦林

利巴韦林可作为抗病毒药物用于治疗婴儿病毒性结膜炎。其能够通过干扰RNA和蛋白质合成来阻断多种RNA和DNA病毒的复制过程。 肝损伤患者应谨慎使用。

4.干扰素

干扰素可以辅助治疗病毒性结膜炎。它是一种广谱抗病毒药物，可通过多种机制抑制病毒复制。 使用时应注意可能出现的流感样症状和其他全身不良反应。

此外，在使用任何药物之前都应该咨询医生以确保安全有效。对于婴儿病毒性结膜炎，家长还要注意保持宝宝眼部卫生，避免接触刺激性物质，以免加重病情。