HPV病毒即人乳头瘤病毒，肩膀上HPV病毒感染，可以通过药物治疗、物理疗法、手术治疗等方式清除病毒。患者一旦出现HPV病毒感染，可能会引起肩膀部位的寻常疣、扁平疣、丝状疣等皮肤疣，建议患者及时就医，在医生的指导下进行治疗。

1、药物治疗：患者可以遵医嘱外用咪喹莫特乳膏、重组人干扰素α2b凝胶等药物，在一定程度上可以抑制HPV病毒的生长繁殖，但是患者在使用时可能会出现疼痛、刺痒等不良症状，还可能会引起过敏反应，所以应遵医嘱使用;

2、物理疗法：患者还可以在医生的指导下进行激光、冷冻、电灼等物理治疗，利用激光产生的热效应，灼烧、破坏肩膀上的疣体，达到清除HPV病毒的效果;

3、手术治疗：对于肩膀上长有疣体较大的患者，或者使用药物治疗效果不佳的患者，可以选择进行手术切除治疗。术后患者还应注意避免伤口碰水，以免引起感染，影响伤口恢复;

4、其他：建议患者适当进行跑步、跳绳等体育锻炼，通过增强自身体质，帮助清除HPV病毒。部分患者还可以通过针灸、按摩等方式，促进全身血液循环，增强新陈代谢，在一定程度上也可以辅助清除HPV病毒。

建议患者在日常生活中保持良好的作息习惯，避免熬夜、吸烟、饮酒等不良生活习惯。平时要注意饮食均衡营养，可以多吃一些苹果、猕猴桃、胡萝卜等新鲜的水果和蔬菜，补充身体所需的营养物质。