大腿内有小核，疼痛的原因可能是感染、血液循环不畅、肌肉损伤、脂肪瘤等。建议患者及时到医院通过检查明确具体原因，然后根据医生建议进行针对性治疗。

1、感染：如果患者体内出现结核分枝杆菌感染，则可导致机体出现结核病，或者患者腿部受到细菌感染，炎症扩散到大腿内侧，则可导致局部淋巴结肿大，伴有疼痛症状，且会出现发热、乏力等症状，患者要在医生指导下使用异烟肼片或利福平胶囊等药物进行治疗;

2、血液循环不畅：如果患者久坐或者不进行锻炼，则可导致腿部血液循环不畅，容易导致腿部出现小核，且伴有疼痛的症状。如果患者症状不是很严重，可以通过局部热敷等方式进行缓解，同时要适当进行锻炼，避免久坐;

3、肌肉损伤：如果运动量过大，则可导致腿部肌肉承受力度过大而出现损伤，导致局部神经受到刺激后引起疼痛症状，可表现为大腿内有小核，疼痛。患者可以在医生指导下使用布洛芬胶囊或塞来昔布胶囊等药物缓解疼痛，同时要适当进行休息;

4、脂肪瘤：如果患者身体代谢出现异常，则可导致出现脂肪瘤，如果脂肪瘤生长到一定程度可压迫局部神经，导致大腿内有小核，伴有疼痛的症状。如果患者确诊为脂肪瘤，可以在医生指导下通过手术进行切除。

除此之外，外伤、腰椎间盘突出症、股骨头坏死、骨肿瘤等原因也可导致大腿内有小核，疼痛的情况。患者应根据具体原因进行治疗，自己不要盲目使用药物。同时要保持良好的饮食习惯，要多吃清淡食物，不要吃辛辣食物。