益生菌大便困难，可能是益生菌不足、益生菌过量导致，也可能是饮食不当、功能性消化不良等原因导致。建议在医生帮助下，明确引发大便困难的具体原因，进行针对性处理。

1、益生菌不足：人体肠道中的有益菌数量较多，可以帮助胃肠道蠕动，益生菌不足导致肠道功能减弱时，可能会影响胃肠道蠕动，出现大便困难的情况。此时应遵医嘱使用益生菌制剂补充，比如地衣芽孢杆菌活菌颗粒、双歧杆菌四联活菌片等，逐渐改善益生菌不足引起的大便困难症状;

2、益生菌过量：人体补充益生菌的同时，盲目过量补充，可能导致肠道菌群紊乱，造成渗透性腹泻，导致大便困难。此时应减少益生菌补充量，可以在医生的指导下，通过口服乳酸菌素片等药物补充益生菌;

3、饮食不当：在服用益生菌期间，食用过多坚硬、粗糙、辛辣的食物，如坚果、辣椒等，可能会导致大便困难。此时与益生菌本身无关，应注意饮食清淡，多吃小米粥、面条等食物促进肠胃蠕动;

4、功能性消化不良：如果自身存在功能性消化不良，可能会出现腹部胀气和食欲下降的症状，有时也会伴随大便困难的现象，此时与益生菌本身无关。可以通过改善生活方式，比如在饮食上避免吃油腻、生冷和辛辣的食物，以及进行适当运动等帮助改善。如果症状严重，可遵医嘱使用健胃消食片等药物治疗。

除上述原因外，导致此现象的其他疾病还有肠梗阻等，如果长期存在大便困难的情况，应及时到医院消化内科就诊，完善视诊、胃肠镜等检查。