孕酮低但是B超正常，可能是生理因素引起的，也有可能是黄体功能不全、胚胎发育不良等病理因素导致的。建议孕妇及时去医院进行检查，并在医生指导下根据不同的原因采取相应的处理措施。

一、生理因素

如果女性处于妊娠早期阶段，此时体内的人绒毛膜促性腺激素水平会迅速升高，从而抑制卵巢排卵，使雌激素和孕激素分泌减少，进而出现孕酮偏低的情况。这是一种正常的生理现象，一般不需要特殊治疗，在怀孕三个月后会逐渐恢复正常。

二、病理因素

1.黄体功能不全：由于黄体功能不全会导致孕酮分泌不足，所以会出现上述情况。如果是黄体功能不全引起的，可以在医生的指导下使用地屈孕酮片、黄体酮胶囊等药物进行补充治疗。

2.胚胎发育不良：如果胚胎染色体异常或受到外界环境的影响，则可能会引起胚胎发育不良，也会出现孕酮降低但B超正常的现象。对于这种情况，患者需要定期复查，必要时可以通过手术的方式终止妊娠。

除此之外，还可能与先兆流产、宫外孕等原因有关，建议患者及时就医，完善相关检查，明确具体病因后再遵医嘱进行针对性治疗。