肛门指检里面很痛，可能是由于检查时对局部造成刺激引起。但也可能与患者本身存在疾病有关，如痔疮、直肠炎等。

一、非病理因素

在进行肛门指检的时候，会对局部组织产生一定的压力和摩擦力，从而导致疼痛症状出现。一般属于正常的生理现象，在经过一段时间的休息后可自行缓解。

二、病理性因素

1.痔疮：如果长期不良排便习惯或经常进食辛辣刺激性食物，则容易诱发该疾病。患病之后会导致肛管或者直肠下端充血肿大，并且还会伴有排便出血以及疼痛等症状。此时可以在医生指导下使用马应龙麝香痔疮膏、复方角菜酸酯乳膏等药物治疗。必要时也可以采取手术的方式进行切除，比如吻合器痔上黏膜环切术、外剥内扎术等。

2.直肠炎：是指发生在直肠部位的急慢性炎症性疾病，发病原因与感染因素、自身免疫功能障碍等原因有关。患病之后会因为炎症反应而出现腹部胀痛、腹泻、里急后重感等症状。可以遵医嘱服用美沙拉嗪肠溶片、柳氮磺吡啶肠溶片等药物治疗。对于病情比较严重的患者还需要通过全结直肠切除加回肠储袋肛管吻合术等方式进行治疗。

除此之外，还可能是因为肛裂、肛周脓肿等因素引起的。建议及时前往医院就诊，完善检查明确病因后，在医生的指导下给予针对性处理或治疗。