肾结石痛起来大便困难，可能是由于输尿管痉挛、肾结石刺激输尿管壁，或者引起肾盂肾炎、肾积水，需要根据具体情况进行治疗。

1、输尿管痉挛：由于结石刺激输尿管壁，输尿管发生痉挛，导致输尿管上段痉挛性收缩，引起肾绞痛，同时又因为疼痛导致肠管痉挛性收缩，使肠管蠕动功能减弱，从而导致肾结石痛起来大便困难。建议及时解痉止痛治疗，如在医生指导下肌肉注射解痉药物，常见药物有盐酸特拉唑嗪、盐酸坦索罗辛等，必要时也可以行输尿管镜下碎石取石术等手术治疗;

2、肾结石刺激输尿管壁：结石刺激输尿管壁引起输尿管壁痉挛，导致肾绞痛发作，同时又因疼痛导致肠管痉挛性收缩，使肠管蠕动功能减弱，从而导致肾结石痛起来大便困难。治疗上需要解痉止痛治疗，如在医生指导下肌肉注射解痉药物，常见药物有盐酸特拉唑嗪、盐酸坦索罗辛等，必要时也可以行输尿管镜下碎石取石术等手术治疗;

3、引起肾盂肾炎：肾结石导致肾盂引流不畅，引起肾盂积水，此时若伴有细菌感染，容易波及到输尿管和膀胱，引起肾盂肾炎。此时患者除了有肾结石痛起来大便困难的症状外，还会伴有寒战、高热等症状。建议及时解痉止痛治疗，如在医生指导下肌肉注射解痉药物，常见药物有盐酸哌替啶、阿托品等，也可以选择静脉滴注抗生素，常用药物有左氧氟沙星、环丙沙星等;

4、肾积水：由于肾结石导致输尿管梗阻，此时肾脏产生的尿液无法及时排出体外，导致肾积水。若同时伴有细菌感染，可导致肾结石痛起来大便困难。若症状较轻，可以通过输尿管支架植入术扩张输尿管，必要时也可以行经皮肾镜碎石取石术进行治疗。