睾丸萎缩不会直接影响大脑，但如果是由其他疾病引起的，则可能会对大脑产生间接的影响。

如果睾丸萎缩是由于外伤、感染等原因导致的，这些原因除了会导致睾丸组织受损外，还可能会引发全身炎症反应。而全身炎症反应会通过神经内分泌途径影响中枢神经系统，从而引起认知功能障碍等大脑异常表现。

因此，这种情况下睾丸萎缩与大脑异常之间可能存在一定的关联。

某些特定的遗传性疾病，如克氏综合征，可导致继发性脑发育迟缓或智力低下，进而影响大脑发育。此时需要针对具体病因进行治疗，例如使用甲睾酮替代疗法来改善克氏综合征的症状。

在关注睾丸萎缩的同时，应注意观察是否伴随有其他症状，以评估对大脑可能产生的影响。建议定期进行体检，包括激素水平检测和影像学检查，以便及时发现和处理任何潜在的问题。