小朋友刷了牙还有龋齿可能是由于牙齿发育矿化不全、食物残留等原因引起的。

牙齿发育矿化不全：如果小朋友存在钙磷代谢异常、维生素D缺乏等问题，可能导致牙体组织矿化不足，使牙齿更容易受到细菌侵蚀。这种情况下，即使定期刷牙也可能无法完全清除口腔中的致龋菌，从而出现龋齿。

食物残留：如果不注意口腔卫生，食物残渣会在牙齿表面停留并发酵产酸，加剧牙齿脱矿进程。虽然通过刷牙可以去除大部分食物残渣，但难以彻底清洁到所有微小缝隙，所以仍然会有少量食物滞留，导致龋齿持续发展。

此外，若龋洞内有软化的牙体组织或食物嵌塞，仅靠机械摩擦可能难以彻底清除，此时可考虑使用牙线或龈沟刮治器协助清理。

日常生活中，家长应督促孩子养成良好的口腔卫生习惯，每次进食后及时漱口，并且要保证足够的睡眠时间，有利于促进机体的新陈代谢，增强抗病能力。