超声波碎石可能对肾囊肿造成一定影响，但具体影响因人而异。

由于超声波碎石过程中产生的高能级超声波可使肾囊肿中的液体震荡，可能导致囊壁破裂，引发血尿、疼痛等不适症状。此外，若操作不当，还可能导致周围组织受损，增加并发症的风险。因此，对于有肾囊肿的患者，应在专业医生指导下评估是否适合进行该项治疗。

在某些情况下，如果囊肿直径大于4厘米或存在感染迹象，则可能需要手术干预。对于此类较大的囊肿，采用经皮穿刺引流术是一种较为安全有效的方法，其通过皮肤直接进入囊腔内将囊液抽吸出来，然后注入硬化剂以缩小囊腔体积。

针对肾囊肿的治疗需谨慎考虑，并结合个体差异制定方案。除上述提及的因素外，还要注意避免使用可能引起肾脏损害的药物，如非甾体抗炎药，以减少潜在风险。