药物流产后第三天腹痛腹胀可能是正常的生理反应，但也有可能存在感染或其他并发症的风险。

腹痛腹胀是药物流产常见的副作用，因为药物会促进子宫收缩以排除胚胎组织。

在大多数情况下，这种疼痛是轻微到中度的，并且随着时间逐渐减轻。但如果伴随有发热、阴道异味或持续性严重腹痛，则可能是感染或其他并发症的表现，需要及时就医评估。

如果腹痛伴有大量出血或阴道分泌物异常增多，应立即就医，以排除宫腔残留或感染的可能性。

总之，在药物流产后，腹痛腹胀通常是正常现象，但若症状加重或伴有其他不适，应及时就医以便获得适当的治疗。建议患者注意休息，避免剧烈运动，保持外阴清洁干燥，以免引起感染。