肛门镜一般是指电子肠镜，是一种长镜子，可以检查肛门、肠道。肛门指检和电子肠镜的主要区别在于检查的位置不同、检查的方法不同、检查的目的不同，以及检查的过程中的疼痛程度不同。

1、检查的位置不同：肛门指检是指医生将食指伸入患者肛门中进行一提肛运动，如果患者存在内痔，一般会在肛门中发现内痔团块，还可以观察到肛门边缘和肛门内部，并判断其是否存在出血、感染等。而电子肠镜主要是从患者的肛门处进入，可以在电子摄像系统中显示出结肠镜，可以观察到肠道是否存在病变;

2、检查的方法不同：肛门指检主要是医生用手指伸进患者肛门中进行检查，通常不需要进行麻醉。而电子肠镜通常需要在麻醉下进行检查，需要进行麻醉;

3、检查的目的不同：肛门指检通常可以检查出患者是否存在肛门息肉、肛乳头肥大等疾病，可以明确其是否存在癌变的可能。而电子肠镜可以观察肠道是否存在占位性病变，如果存在病变，还可以观察病变的范围、大小、表面光滑程度等;

4、检查的过程中疼痛程度不同：由于肛门指检时需要进行麻醉，所以患者通常不会有疼痛感。而电子肠镜检查时通常需要进行麻醉，在检查过程中可能会出现胀痛感觉。

如果患者在平时出现便血、腹痛、腹部不适等症状，建议及时到医院的消化内科或肛肠科就诊，完善直肠指检、电子肠镜等检查，以明确诊断。