底下瘙痒小便时刺痛，可能是泌尿系统感染、男性阴囊炎、女性阴道炎、阴道毛滴虫病、尖锐湿疣等原因引起，建议前往泌尿外科或妇科就诊，查明其原因，再给予相应的治疗。

1、泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎等，由于炎症刺激可导致尿道、膀胱充血、水肿，引起底下瘙痒、小便时刺痛，通常还伴有尿急、尿频等症状。可给予阿莫西林、头孢克洛等药物抗炎治疗;

2、男性阴囊炎：阴囊部位褶皱较多，如果不注意个人卫生，容易诱发细菌感染，形成毛囊炎，出现底下瘙痒小便时刺痛的现象，还会伴有丘疹。可给予莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏外用涂抹;

3、女性阴道炎：阴道发生炎症也会引起底下瘙痒小便时刺痛，由于炎症刺激，白带会增多，伴有异味、外阴灼热感等。可给予甲硝唑栓、双唑泰栓等药物治疗;

4、阴道毛滴虫病：由于滴虫感染会造成阴道毛滴虫病，也可引起底下瘙痒小便时刺痛，伴有白带增多、泡沫样的白带，可给予甲硝唑栓、替硝唑栓等药物治疗;

5、尖锐湿疣：不注意个人卫生或者有多个性伴侣，容易形成人乳头瘤病毒感染，形成尖锐湿疣，也可引起底下瘙痒小便时刺痛。可以给予咪喹莫特乳膏外用涂抹，必要时再给予液态冷冻、激光等物理治疗方法。