婴幼儿消化不良腹泻可以考虑使用蒙脱石散、双歧杆菌、枯草杆菌、胰酶、胃蛋白酶等药物进行治疗。但是，由于婴幼儿的特殊体质和药物可能产生的影响，建议在儿科医生的指导下使用药物，并密切观察孩子的病情变化。

1.蒙脱石散

蒙脱石散可以用于治疗小儿消化不良引起的腹泻。该药物能吸附病原体和毒素，缓解腹泻症状。服用时需注意按体重给予剂量，新生儿应遵医嘱使用。

2.双歧杆菌

双歧杆菌制剂适用于改善肠道菌群失调所致的腹泻、腹胀。此菌能够抑制有害细菌过度繁殖，调节肠道微生态平衡。对本品过敏者禁用。此外，若长期服用抗菌药质，应在医生指导下应用。

3.枯草杆菌

枯草杆菌制剂可辅助治疗由敏感菌株引起的腹泻。此菌属厌氧性革兰氏阳性杆菌，在体内产生多种消化酶及有机酸，有助于食物的消化吸收。对于肠梗阻患者禁止使用。另外，由于其具有一定的活化作用，因此建议在饭前口服以充分发挥疗效。

4.胰酶

胰酶可用于治疗消化不良引起的腹泻。胰酶中含有脂肪酶、淀粉酶等物质，能帮助分解食物中的蛋白质、脂肪和碳水化合物，减轻消化不良的症状。使用时应注意不宜与抗酸剂同时服用，以免影响药效发挥。

5.胃蛋白酶

胃蛋白酶适用于食欲缺乏引致的消化不良。本品能激活其他消化酶，促进蛋白质分解为小分子肽和氨基酸，从而提高机体对营养物质的吸收能力。使用时应注意不宜与抗酸类药物同服，以免影响药效。

针对婴幼儿消化不良腹泻的情况，家长还要注意调整饮食结构，尽量让患儿食用易消化的食物，如小米粥、软面条等，有利于减轻胃肠负担。