指甲盖凹凸不平可能是由维生素缺乏、微量元素缺乏、真菌感染、遗传因素或外伤引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.维生素缺乏

维生素是维持机体正常生理功能所必需的一类低分子有机化合物，当人体长期摄入不足时会导致相关营养素缺乏，进而影响到指甲生长和健康。可通过食用富含维生素的食物如猕猴桃、胡萝卜等来补充缺失的维生素。

2.微量元素缺乏

微量元素参与多种生物过程，包括合成角蛋白。其缺乏可能导致角质细胞生长异常，从而出现指甲变薄、易碎等问题。可适当通过饮食调整进行改善，日常生活中可以多吃一些菠菜、海带等食物。

3.真菌感染

真菌侵入甲板层后，在局部大量繁殖并产生炎症反应，导致甲床增厚、甲板变脆，最终形成甲癣，即俗称的“灰指甲”。患者可在医生指导下使用盐酸阿莫罗芬搽剂、环吡酮胺乳膏等药物进行抗真菌治疗。

4.遗传因素

部分指甲凹凸不平可能是由遗传引起的，因为指甲的形态也受基因控制。对于这种情况通常无需特殊处理，定期观察即可。

5.外伤

外力作用于指甲可能会引起微小损伤，如果不及时修复可能会影响指甲生长，导致指甲表面不平整。轻微外伤可通过保持指甲清洁干燥促进愈合，严重者则需就医评估是否需要专业治疗。

针对指甲盖凹凸不平的情况，建议患者定期监测指甲的变化，必要时进行指甲组织活检以排除其他潜在的病理原因。此外，注意个人卫生，避免接触刺激性物质，保持指甲干燥整洁，有助于减少不适的发生。