新疆维吾尔自治区胸科医院始建于1958年，其前身是自治区肺科医院(自治区结核病防治研究院)，隶属于自治区卫生厅，是集医疗、预防、科研、教学为一体的技术力量雄厚、设备先进、服务优良的以治疗胸部疾病为主的大型三级专科医院，是全疆唯一的自治区级结核病诊治医院以及自治区结核病、艾滋病双重感染定点医院。
医院位于乌鲁木齐市延安路，占地面积14926平方米，建筑面积20676平方米，其中医疗业务用房19484平方米。
医院现拥有各类卫生专业技术人员420人，其中高级职称61人，中级职称110人，分别占专业技术人员的15%和26%，各类专业技术人员占职工总数的83%，卫生技术人员占职工总数的75%。
医院现设有：2个结核科、2个综合内科、胸外科、普外科、骨科、呼吸科、内分泌科、手术麻醉科、ICU、急诊科12个临床科室，功能科、检验科、放射科、药剂科4个医技科室，2个社区门诊。医院现编制床位300张，开放床位480张。医院总资产11000万元，全年业务总收入7200万元。全年门诊6万余人次，收住病人7500余人次，手术850例，床位使用率120%。
经过50余年的发展，医院立足强化专科优势，坚持发展综合科目作为支撑，加大多发病、常见病的诊治力度，形成了具有较强诊断、急救和综合治疗能力的业务体系，医院具有特色的专科治疗技术得到全面提高。胸外科、结核科、呼吸内科、综合内科等一批重点专科，在肺部肿瘤、纵隔肿瘤、结核性脑膜炎、结核性胸膜炎、结核合并糖尿病、结核病艾滋病双重感染、腹部结核、骨与关节结核、淋巴结核、支气管哮喘、睡眠呼吸障碍治疗方面以及开展的经纤维支气管镜肺活检，介入治疗，特别是对难治性耐多药结核诊治有独到之处，并在其他胸部疾病的内外科治疗方面积累了丰富的经验，在疆内具有较强优势。
医院拥有一批全疆知名专家，具备先进的结核病诊断治疗技术和仪器设备。在“重症、复杂、耐药、难治性结核疾病”、“非结核分支杆菌肺病”、“经纤维支气管镜肺活检”、“介入治疗”等诊疗领域在全疆始终处于领先地位，部分诊疗方案已处全国领先水平，已形成独有特色和一流品牌。
医院坚持“科技兴院”的发展战略，不断加强与一流医院的技术协作，先后与上海肺科医院、北京胸科医院、广州胸科医院、广州呼吸病研究所等知名医院建立了长期的技术协作关系，定期邀请专家来医院开展会诊、查房、手术、讲学等活动，推动了医院各项工作全面健康发展，综合实力得到明显提升。医院现已逐步完成急救通道和重症监护病房软、硬件重组，形成具有一定院前急救、转运和完整监护抢救技术与设施的体系，建立并完善了综合门诊及各类病区，力争年内完成结核门诊与综合门诊的分诊、结核病区与综合病区的分设工作，做到传染病区与非传染病的分设，避免院内交叉感染的发生，确保住院患者的安全。扩大社区卫生服务，拓宽医疗服务领域，满足了社会多层次、多样化卫生服务的需求。
自治区胸科医院经过几代人的不懈努力和奋斗，在建筑规模、技术开发、人才培养和专业学科建设方面都有了长足的发展。目前，“人有专长、科有特色、院有优势”的格局已初步形成。
“博爱、诚信、奉献、创新” 是我们始终信守的服务信条，“爱心奉献、细心诊疗、热心服务、忠心患者” 是我们深入内心的服务理念，“患者至上、呵护生命、祛除病痛、增进健康”是我们努力奋斗的不懈追求。自治区胸科医院全体员工将以更加崭新的面貌、更加强大的实力和更加优质的服务为您的健康保驾护航!
医院多次受到国家、自治区、乌鲁木齐市各上级部门的表彰和奖励。1993年医院被命名为“乌鲁木齐市级文明单位”;2001年医院被命名为“先进工会组织”;2002年医院被命名为 “精神文明建设先进单位”;2003年医院被命名为“结核病控制项目工作先进单位”、 “自治区防治非典工作先进党组织” 、“精神文明建设先进单位”;2004年医院被命名为“自治区卫生系统行业作风建设先进集体”;2005年医院被命名为“AA级诚信单位”;2006年医院被命名为“乌鲁木齐市卫生达标单位”、“自治区结核病防治工作先进集体”;2007年医院被命名为“综合治理、计划生育达标优秀单位”、“安全生产目标管理考核工作先进集体”、“传染病网络直报先进集体”。医院手术麻醉科被命名为“巾帼文明示范岗”、普外科被命名为“青年文明号”、护理部被评为“护理学会第九届理事学会工作先进单位”、临床一支部被评为“厅直系统先进基层党组织”;2008年医院荣获“新疆卫生系统思想政治工作先进单位”、“花园式单位”、“乌鲁木齐地区十大优秀中国志愿者服务团队”、“民族团结先进集体”、“自治区模范职工之家” 等荣誉称号。
医院配备有：飞利浦16层螺旋CT，柯达数字影像存储系统CR400， GER500拍片机，西门子彩超，GE彩超，西门子1250毫安大型X光机，奥林巴斯纤维支气管镜，电子支气管镜，森迪斯2200型电脑肺功能仪，大C 臂，史塞克胸腔镜、腹腔镜，电子胃镜，肠镜，呼吸睡眠监测仪，肺功能仪，二十余台多功能监护仪，十余台呼吸机。检验科配备有：梅里埃VITEK32微生物细菌仪，日立7060全自动生化分析仪，结核杆菌快速培养仪，快速冰冻切片仪，全自动分支杆菌检测系统，全自动5分类血液分析仪，免疫发光仪等先进设备。