怀孕43天药流一般可以流干净。

怀孕43天属于早期妊娠阶段，此时胚胎尚未完全形成，且子宫颈口相对较为松弛，有利于药物促进子宫收缩，促使胚胎及其附属物排出体外。

怀孕43天药流是否能够流干净取决于个体差异，通常与是否有禁忌症、是否存在宫腔粘连等有关。

药物流产后需注意观察阴道出血量以及持续时间，并定期复查以确保子宫内膜恢复正常。