宝宝补钙后大便发黑可以考虑使用补铁剂、益生菌制剂、消化酶制剂、维生素B6、胃黏膜保护剂等方法进行治疗。如果症状持续或伴有其他不适，应咨询医生以确定适当的治疗方案。

1.补铁剂

补充铁元素以改善缺铁性贫血，根据医嘱选择口服或注射铁剂。用于治疗缺铁性贫血。需要监测血象及铁代谢指标。

2.益生菌制剂

通过增加肠道有益菌群数量来改善消化吸收功能，可选用双歧杆菌、乳酸菌等产品按推荐剂量服用。适用于调节肠道微生态环境。在使用时应注意个体差异及可能出现的不良反应。

3.消化酶制剂

补充缺乏的消化酶，促进食物分解吸收，如胰蛋白酶、淀粉酶等。针对消化功能减退引起的不适症状。需遵循医师指导，并注意可能出现的过敏反应。

4.维生素B6

补充不足的维生素B6，可用于缓解因缺乏引起的相关症状。对于巨幼细胞性贫血具有一定的辅助治疗效果。

5.胃黏膜保护剂

在胃黏膜表面形成一层保护层，减少胃酸和胃蛋白酶对黏膜的损伤。主要用于缓解胃炎、胃溃疡等疾病引起的疼痛和不适感。

在考虑给宝宝补钙的同时，应确保摄入充足的水分以帮助排出黑色粪便。同时，建议定期评估孩子的生长发育情况以及是否需要调整饮食结构或进一步检查。