肛门指检和肛门镜检查通常不痛苦，但也可能出现疼痛的情况。

肛门指检和肛门镜检查都是常见的直肠与肛门部位检查手段，通过专业医师操作，一般不会导致明显疼痛。若出现疼痛症状可能是由个人体质差异、紧张情绪等因素引起的。

如果患者有痔疮或肛裂等疾病，在进行肛门指检和肛门镜检查时可能会感到轻微不适或疼痛。因为这两种疾病的病变位置较为敏感，易受触碰而引起局部刺激。

在进行肛门指检和肛门镜检查前，应避免食用高纤维食物及饮酒，以免影响肠道准备和诊断结果的准确性。同时注意保持肛门区域清洁卫生，以减少感染风险。