衣原体感染可能会影响精子质量，包括精子数量、活力和形态等，从而增加精子畸形的风险。

衣原体是一种细菌，可通过性传播感染人体，尤其是男性生殖系统。感染后，机体免疫系统会启动防御机制对抗病原体，此时会产生大量的自由基，这些自由基会对DNA造成氧化损伤，进而引起精子DNA畸变，导致精子畸形的发生。此外，衣原体感染还可能导致精液中的白细胞增多，这些白细胞在吞噬病原体的同时也会误吞精子，进一步加重精子的损害。

如果患者存在长期禁欲或缺乏营养素等情况，也可能导致精子畸形率升高，但与衣原体感染无关。

针对衣原体感染引起的精子畸形，应积极治疗原发疾病，并注意规律生活，避免过度疲劳，以减少精子畸形的发生概率。