复杂性肛瘘术后会感到一定的疼痛，但程度因人而异。

复杂性肛瘘术后的疼痛主要是因为肛门周围神经密集，且局部存在炎症反应引起的。

此外，手术过程中切开或切除病变组织也会导致疼痛加剧。

复杂性肛瘘术后可能伴随不适症状包括瘙痒、排便困难等，这些症状通常在术后1-2周逐渐减轻。

术后患者应遵循医嘱做好伤口护理，避免感染，同时还要注意保持大便通畅，以免加重不适感。