做完肛瘘手术吃辣椒肛门疼可能是由于辛辣食物引起的局部毛细血管扩张和炎症反应所致。

因为辣椒中的辣味物质会刺激消化道黏膜，使局部毛细血管扩张，血液循环加速，从而引发疼痛感。同时，辛辣食物还会促使机体产生前列腺素E2等炎症介质，这些介质能够增加细胞通透性和血管壁的渗透压，导致组织水肿和渗出，进一步加重肛门疼痛的症状。

患者在术后恢复期食用了过于油腻或难以消化的食物时，可能会引起肠道功能紊乱，进而出现腹泻、腹痛等症状，此时若不及时处理可能导致肛门部位受到摩擦与刺激而加剧不适感。

术后患者应避免摄入辛辣、油腻以及难以消化的食物，以减少对肛门区域的刺激和负担，促进伤口愈合和身体康复。