泉州市中医院成立于1983年8月15日。建院20多年来，在各级政府的领导下，通过全院职工的共同努力，已建成为一所具有一定规模，设备功能齐全的综合性中医医院。
1995年8月通过省卫生厅“三级乙等中医院”的评审，成为泉州市首家评定等级的医院。
1996年8月国家中医药管理局授牌为“全国示范中医医院”。
2002年4月泉州市卫生局等部门核定我院为第一批非营利6027医疗机构。
2002年7月，成为福建中医学院临床医学研究生教学医院。
2002年9月被省卫生厅批准为福建省中医学院非隶属附属医院。
2003年被泉州市政府确定为泉州医学高等专科学校(筹)附属医院。
医院把“科技兴院、规范管理”作为内涵建设的重心。把现代化综合型观念融入中医医院建设之中，提高整体综合功能，落实诊疗规范，加强质量控制，提高中医治疗率，扩大单病种管理范围，推行整体护理，加强院感控制，开展放心药房活动，强化医疗安全教育，规范临床教育管理模式，做好仪器设备更新提档，从各个环节做到“人员素质达标，管理达标，质量达标，等级达标”。目前，年门诊工作量28万人次，年住院量8000人次。
医院坚持以中医学术为主体的办院方向，坚持把中医专科(专病FF09作为医院内涵建设的重点，将“人有专长、科有特色、专业有突破口”为技术发展的中心工作，推行“树名医、创名科、以人带科、以科带院”战略，把握好“五专” (专家、专病、专药、专科、专技)为核心的中医专科(专病)发展方向。把发病率高、西医药无满意疗效、而中医药有特色、有优势的病种，作为专科(专病)建设重点，在重点病种或病种的重要环节上明确学术与技术主攻方向。目前，针灸专科、中医妇科专科、中西医结合脑血管专科是福建省中医重点专科，在省内外及东南亚一带均有一定声誉。中医肾病专科是第四批省级重点中医专科建设项目，蛇伤科、肛肠科、骨关节病和腰腿痛专科是第一批市级中医重点专科。
人员结构及专业设置。经过几年发展，医院卫技人员逐步形成较完整的梯队结构和专业特点。医院病床编制370张，在编职工463人，卫生技术人员406人，其中享受国务院特殊津贴者2人，主任医师16人，副主任医(护、药)师68人(其中正教授6人，副教授11人，硕导13人，博士4人，硕士11人，在职硕士研究生4人)，中级职称168人。医院钟秀美、丁秀贝、张永树、林禾禧、苏稼夫、林金长、郭鹏琪等多位老中医专家均被确定为全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师。
医院科室门类齐全，设有神经内科、心脑血管内科、呼吸内科、消化内科、肝科、肾内科、新生儿科、小儿内科、肿瘤科、内分泌科、老年病科、普外科、神经外科、胸外科、泌尿外科、肿瘤外科、血管病外科、蛇伤科、骨伤科、创伤外科、关节脊柱外科、四肢外科、肛肠科、针灸科、康复科、推拿科、产科、妇科、男性内科、皮肤科、医学美容科、五官科、ICU中心病房、麻醉科、社会保健科、急诊科、口腔科、临终关怀科等38个临床医疗科(室)。还设有影像科、检验科、病理科、营养科、消毒供应科、功能检查科、手术室、核医学科、输血科、制剂中心等10个医疗技术科(室)和11个职能科室。蛇伤科、肝科、心脑血管内科、肿瘤科、骨伤科、针灸康复科、妇科、肛肠科等专科独具特色，屡获好评。
内科系统建立了CCU病房，配备日本心电起博除颤监护仪、美国多参数监护仪、HP—43120A除颤监护仪、美国双联腹透系统、德国费森尤斯血透仪、血滤机、德国EVITA—Ⅱ全自动呼吸机、活动平板心电图仪，对心脑血管、呼吸、消化、泌尿、内分泌等系统急、危、重症均能进行著有成效的抢救和治疗。
外科系统建立了ICU病房，配备德国EVITA—Ⅱ全自动呼吸机、CSI—507SD多参数监护仪、日本美能TC—UI自动牵引床、洁净手术室、麻醉科配有德国蛇牌GK05022双极电凝、RY—11多功能麻醉机、多功能手术床、高频电刀等，全面开展颅脑、胸腹、泌尿及骨伤、妇产科等大、中型手术。
随着改革开放不断深入，医院已形成医疗特色突出、临床疗效显著、医院功能健全、管理水平较高、医德医风良好的社会主义医院，医院以“一流医术、一流服务”为宗旨，竭诚为海内外同胞服务。
重视科教工作，医教研同步发展。医院设有7个临床教研室，5个专病研究室。建院以来，获国家中医药科学技术进步奖1个，福建省政府科技进步奖3个，福建省卫生厅医药卫生科技成果奖等7个，泉州市人民政府科学科技进步奖25个。
“全国示范中医医院”、省医学教育进修基地、省全科医师培训定点医院、省住院医师规范化培训试点医院、省新药临床验证基地和省道路交通事故伤员救治定点医院、泉州市“120”急救站，省肿瘤医院和省肝病协会协作医院。
医疗仪器齐全，设备先进。拥有德国西门子全身CT、彩超、B超，800毫安数字减影X光机、500毫安带电视遥控X光机、C臂X光机、贝克曼全自动血液生化分析仪、TCD检测(经颅多普勒)、24h动态心电图、电子胃镜、肠镜、关节镜、腹腔镜、宫腔镜、磁免检测、美国太空活动平板负荷试验等一批先进医疗设备，为临床诊断治疗提供可靠支持。