蹲着大便时小便刺痛，可能是外伤所致，也有可能与尿路感染、膀胱炎、前列腺炎等疾病有关。建议患者及时就医，明确诊断后在医生指导下进行治疗。

1、外伤：如果在工作或生活中，下蹲时间过长，可能会导致局部肌肉受到牵拉，造成肌肉损伤，从而出现蹲着大便时小便刺痛的症状。建议患者多休息，可外用云南白药气雾剂，如果疼痛没有缓解，可以口服布洛芬缓释胶囊等药物进行治疗;

2、尿路感染：如果平时饮水较少，或不注意个人卫生，可能会导致尿路感染，出现炎症反应。排尿时炎症会刺激尿道黏膜，从而导致患者出现蹲着大便时小便刺痛的症状。患者可遵医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗，日常要多喝水、多排尿;

3、膀胱炎：一般是细菌感染导致，会使膀胱黏膜受到炎性因子的刺激，导致局部充血、水肿，在排尿时可能会导致膀胱痉挛，从而导致患者出现蹲着大便时小便刺痛的症状。患者可遵医嘱使用头孢地尼分散片、头孢克洛颗粒等药物进行治疗;

4、前列腺炎：通常与久坐、长期憋尿等因素有关，当患者蹲着时，会压迫前列腺，加重炎症刺激，从而导致患者出现蹲着大便时小便刺痛的症状。患者可遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物进行治疗，日常要避免久坐。