牙根囊肿不会自愈。

牙根囊肿是由于牙齿周围的软组织发生病变而引起的疾病，如果不进行治疗，病变可能会继续发展，导致囊肿扩大、感染等问题。

因此，为了防止疾病的进一步恶化，建议患者及时就医进行相应的治疗。

此外，对于较小且无症状的牙根囊肿，可通过口腔卫生维护观察是否能自行消退；而对于较大或伴有疼痛、感染等症状者，则需积极干预以避免并发症的发生。

日常生活中应注意口腔卫生，定期进行口腔检查和清洁，发现问题及时处理，以减少牙根囊肿等口腔疾病的发生风险。