中国人民解放军第九四医院创建于1946年，先后改称为江淮军区后方医院、皖北军区后方医院、 华东军区14野战医院，1954年10月正式命名为解放军第94医院, 1970年9月由漳州移防南昌。这所大型军队医院有着63年光辉历史。医院属解放军第一军医大学、第四军医大学临床教学医院、 南昌大学医学院教学医院，是一所集医疗、预防、教学、科研、 康复为一体的现代化大型综合性三级甲等医院。医院高、中级技术职务人员、医学博士与硕士生占全院医务人员的60%;设有15个临床科室和10个辅助临床科室，开设床位600张。
1958年金门炮战中，医院成功地挽救了烧伤面积达67%的英雄炮手胡德安。1970年由福建漳州移防南昌，1971年抢救了陆军第89师的救火英雄全国特等残废军人徐效刚(现为江西省残联主席)。1981年全国一等功臣邱国娥被歹徒刺伤在医院救治康复。1998年在抗洪抢险中、抢救了患重症肝炎一等功臣谢永刚，传染科特级护理了37个昼夜......。并在江西医疗卫生史上曾连续创下无数个第一：成功地完成了第一例断肢再植，第一例肾移植，第一例先天性心脏病手术，第一例颈椎弓囊融合高难度手术，第一例心脏血管搭桥手术。
60多年来，一代代医务工作者秉承“博极医源、精勤不倦”的精神，用智慧和汗水创建了一个又一个沉甸甸、金灿灿的品牌学科。如今，医院学科专业齐全，专科特色突出，技术力量雄厚。先后申报并成立了“南京军区心血管内科中心”、"南京军区耳鼻喉微创中心"、“南京军区神经外科中心”、“南京军区优生优育计划生育中心”、南昌创伤外科急救中心、耳鼻喉微创中心、高压气治疗中心、肿瘤中心、X~刀治疗中心、血液透析中心、健康体检中心、妇幼中心、眼科中心等。
耳鼻喉科、急诊科、神经外科、心胸外科、骨科、显微外科、整形外科、心血管内科、神经内科、消化内科、肿瘤科、肛肠外科、口腔科、同位素等是医院特色科室，其中耳鼻喉科室处于南京军区、省内领先水平。
医院先后获军队和地方科技进步奖二等奖6项，三、四等奖30余项，发表学术论文1600余篇。
获救护航空航天员先进军区、军区医德医风建设先进单位、全军营区绿代先进单位、全军为部队服务先进医院、南京军区“十五”医学科技创新组织奖、军区“抗震救灾先进单位”、“江西省医疗收费信得过先进单位”、“江西省十大和谐医院”、“群众满意医院”等称号。
中国人民解放军第九四医院目前拥有逾亿元先进医疗设备，主要大型设备有新购进的美国通用GE64排螺旋CT、江西省第一台飞利浦公司遥控多功能数字化X线系统、达隆公司EBH-3000型数字减影仪、西门子1250MAX光机、大型32座高压氧舱、西门子1-5T核磁共振、GE公司的大C臀机、瓦里安公司 CL600C直线加速器、德国FISHER公司X-刀治疗计划系统、全自动生化分析仪、电子内窥镜、腹腔镜、前列腺镜、超声乳化仪、彩色多普勒等，为来院患者更好的检查、治疗提供了坚实的基础。九四医院近年还先后投资6000余万元新建了住院大楼和影像楼，改善了医疗配套设施。