宝宝睡醒咳嗽的厉害可能是上呼吸道感染、支气管炎、肺炎、哮喘、过敏性鼻炎等疾病的表现，这些疾病可能需要不同的治疗方法。因此，建议家长及时带孩子就医，以便进行准确诊断并接受适当治疗。

1.上呼吸道感染

上呼吸道感染是由病毒、细菌等病原体侵袭引起炎症所致，导致局部黏膜充血水肿和分泌物增多。这些因素刺激会导致睡眠时出现频繁咳嗽。轻者可通过多喝水促进新陈代谢，缓解不适症状；重症患者可遵医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等药物进行抗感染治疗。

2.支气管炎

支气管炎由多种因素引起的气管、支气管黏膜及其周围组织的炎症，主要表现为咳嗽、咳痰等症状。夜间迷走神经兴奋性增高，导致支气管收缩痉挛，从而引起剧烈咳嗽。对于急性发作期的患者，医生可能会开具盐酸氨溴索口服溶液、氢溴酸右美沙芬口服液等止咳化痰类药物以减轻症状。

3.肺炎

肺炎是肺实质或间质部位发生的炎症，由于炎症因子刺激，会引起咳嗽、发热、呼吸困难等症状。夜间睡眠时，呼吸道受到压迫，可能诱发咳嗽加剧。抗生素治疗是肺炎的主要手段，如青霉素V钾片、阿奇霉素分散片等，需依据医师处方进行用药。

4.哮喘

哮喘是一种慢性气道炎症性疾病，常伴有喘息、咳嗽、气促等症状，夜间或清晨更为严重。夜间激素水平变化可能导致气道反应性增加，引起咳嗽加重。控制哮喘病情需要长期管理，包括吸入性糖皮质激素和β受体激动剂，如布地奈德福莫特罗粉吸入剂、丙酸氟替卡松吸入气雾剂等。

5.过敏性鼻炎

过敏性鼻炎患者的免疫系统对特定物质产生过度反应，导致打喷嚏、流涕等症状，夜间平卧位时鼻腔内分泌物流入咽喉部，刺激咽部黏膜，引起咳嗽反射。抗组胺药可用于缓解过敏性鼻炎的症状，如氯雷他定片、盐酸苯海拉明片等，但需按推荐剂量服用。

建议密切观察宝宝的咳嗽频率和强度，必要时进行胸部X光检查或高分辨率CT扫描以评估肺部状况。针对可能出现的并发症，应保持室内空气清新，避免接触已知过敏原，并确保充足的休息以支持免疫系统的健康。