武警甘肃总队医院引始建于1972年。建院近30年来，在上级党委和业务主管部门的正确领导下，医院历届领导班子始终坚持"面向基层、为兵服务"的方向，带领全院官兵艰苦创业、勤以治学，科技兴医，质量建院，从一所设施简陋的野战医院发展成综合性医院
近年来，医院十分注重正规化、现代化建设，始终将医护检诊质量放在首位，一是抓好医疗护理队伍的建设，认真做好医务工作者的选拔、调配、任用工作，积极接收部队、地方院校医疗护理人员，大胆选拔任用年轻医生。二是严格规范医疗护理秩序，严格执行三级检诊、查房、会诊、病例讨论、专科收治、首诊医师负责制等工作制度，按职分级管理，使管理科学化、工作规范化，确保了医疗护理安全。三是加强药品使用管理，认真贯彻《药品管理法》，坚持实行中心摆药制度，严把药品的采购、入库、使用关，保证药品的质量。四是加强医德医风教育，通过开展思想作风纪律整顿、民主评议、评比竞赛等系列活动着力解决存在的问题，使医务人员自觉转变医疗护理观念，树立爱岗敬业的主人翁精神。
医院始终坚持开展精神文明建设，创建百姓放心医院，积极参加地方经济建设，大力开展社会公益事业和医疗帮扶工作，为人民群众做好事，办实事，开展助残助学活动，用实际行动建立起了良好的警政警民关系。医院先后被确定为"甘肃省交通事故特定救治医院"、省免疫学会甲亢治疗中心、兰州市120急救网络医院、省级医疗保险定点医院;被省卫生厅、省残联命名设立为"甘肃省儿麻矫治中心"、兰州医学院定点教学医院;1998年被国家卫生部授予"爱婴医院"称号，同年被武警总部评定为三级乙等医院;被兰州市委、市政府评为"双拥先进单位"、"市级文明单位"。
在新千年里，武警甘肃总队医院将继续遵循全心全意为人民服务的宗旨，振奋精神，开拓进取，以精湛的技术和优良的服务为西部建设做出更大的贡献。
在医疗技术方面，医院始终坚持走院有重点、科有特色、人有专长的路子，以高新技术、高科技设备为依托，搞特色建设，创自己的名优品牌。先后投资上千万元购置了800maX光机，全身CT、彩超、电子胃镜、全自动化生化分析仪、核医学检测仪、血液透析机、高压氧舱、高能聚焦超声波肿瘤治疗机、椎间盘镜等先进的医疗设备，提高了高新技术含量。目前在胸腹外科、儿麻矫治、断肢(指)再植、下肢缩短延长、脏器移植和以椎间盘镜、妇科自凝刀、超声高能肿瘤治疗机等组成的微创外科领域优势突出，对各类内科疾病，重度创伤，急性中毒的诊治急救具有丰富的经验。