三个月没来月经可能是妊娠、多囊卵巢综合征、垂体瘤、甲状腺功能减退症、肾上腺皮质功能不全等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.妊娠

妊娠期间体内激素水平发生变化，导致子宫内膜停止脱落，从而出现停经现象。可通过早孕试纸检测晨尿或者到医院抽血化验人绒毛膜促性腺激素值来确定是否怀孕。

2.多囊卵巢综合征

多囊卵巢综合征是一种复杂的生殖内分泌代谢疾病，以雄激素升高、持续无排卵、卵巢多囊样改变等为特征，表现为多毛、痤疮、月经不规律、不孕等。此病会导致雌激素和孕激素比例失调，影响正常的月经周期。患者可以在医生指导下使用炔雌醇环丙孕酮片、醋酸甲羟孕酮片等药物进行调理。

3.垂体瘤

垂体瘤可压迫下丘脑-垂体轴，干扰正常激素分泌，进而影响月经周期。针对垂体瘤的治疗方法包括手术切除、放射治疗等，需要由专业医师根据具体情况制定方案。

4.甲状腺功能减退症

甲状腺功能减退症时，甲状腺激素合成不足，反馈性地抑制下丘脑TRH的释放，减少垂体前叶TSH的分泌，继而使甲状腺处于低代谢状态，影响月经周期。补充甲状腺素是主要的治疗方法，常用药物有左甲状腺素钠片、甲状腺片等，需遵医嘱用药。

5.肾上腺皮质功能不全

肾上腺皮质功能不全可能导致糖皮质激素和盐皮质激素缺乏，引起电解质紊乱和月经不调等问题。肾上腺皮质功能不全的治疗通常包括糖皮质激素替代疗法，如氢化可的松注射液、泼尼松龙片等，需根据病情调整剂量。

建议定期进行妇科检查以及相关激素水平测定，如雌激素、孕激素等，以评估月经状况并排除其他潜在问题。对于未育女性而言，若存在生育需求且伴有月经异常的情况，则应积极寻找原因并及时处理，以免延误病情。