睡觉起来左边肩胛骨疼可能是睡眠姿势不当、枕头过高、肩周炎、颈椎病、胸膜炎等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.睡眠姿势不当

睡眠姿势不当可能导致肌肉过度拉伸或压迫神经，引起局部血液循环不畅和缺血缺氧，从而导致疼痛。

调整睡眠姿势通常可以缓解不适。例如，使用较硬的床垫和较低的枕头有助于支撑颈部和脊柱，减少压力。

2.枕头过高

枕头过高会使颈部处于前屈位，增加颈部长时间负担，进而诱发左侧肩胛骨周围软组织劳损、炎症等病理变化，出现疼痛的症状。建议患者选择合适的枕头高度以减轻症状，如荞麦皮枕头、乳胶枕头等。

3.肩周炎

肩周炎是由于肩关节周围的肌腱、滑囊和关节囊发生退行性改变而引起的炎症反应，夜间睡眠时局部血液循环减慢，炎症因子刺激周围组织，可表现为肩部酸痛的情况。患者可通过针灸等方式进行治疗，通过针刺穴位来达到舒筋活络的效果，从而改善不适症状。

4.颈椎病

颈椎病是由颈椎长期劳损、椎间盘脱出或骨质增生等情况导致的，当病情发作时，可能会对周围组织产生一定的刺激作用，从而引起肩背部放射性疼痛的现象。对于轻度的颈椎病，可以通过热敷的方式促进局部血液循环，缓解不适症状。

5.胸膜炎

胸膜炎是指发生在胸膜腔内的炎症，此时炎症会刺激到局部的组织结构，从而引起肩胛骨部位出现疼痛感。抗生素治疗是常用的治疗方法，医生会根据感染类型开具相应的药物，如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等。

日常生活中要注意休息，避免剧烈运动，以免加重不适症状。若疼痛持续存在或加剧，应及时就医并完善相关影像学检查，如X光片、MRI扫描等，以便进一步评估病情严重程度并采取相应治疗措施。