畸形精子症患者整个孕期都存在一定的流产风险，具体时间因人而异，通常取决于精子形态异常程度和孕妇年龄。

畸形精子症患者存在精子形态异常，可能影响受精卵的发育，进而可能导致流产。轻度畸形精子症的患者，精子形态异常程度较轻，精子的受孕能力可能不会受到显著影响，因此流产的风险相对较低，可能在怀孕后短时间内发生。重度畸形精子症的患者，由于精子形态异常程度严重，精子的受孕能力受到显著影响，导致胚胎质量下降，进而可能增加流产的风险，可能在怀孕后较短时间内发生。

畸形精子症患者应定期进行孕期检查，监测胎儿发育情况，如发现异常应及时就医，以减少流产风险。