鳃裂囊肿和瘘管的治疗时间因个体差异而异，通常在患者出生后不久或是在儿童时期进行，具体取决于囊肿或瘘管的大小、症状以及是否伴有感染。

鳃裂囊肿和瘘管是胚胎发育过程中鳃沟未完全闭合形成的先天性病变，通常需要手术治疗。对于鳃裂囊肿和瘘管的治疗，如果囊肿或瘘管较小且无症状，可以在患者年龄较大时进行治疗，以减少手术风险，促进术后恢复。如果囊肿或瘘管较大或伴有感染，可能需要尽早进行治疗以避免并发症，如感染扩散、瘘管阻塞等。

在治疗鳃裂囊肿和瘘管时，应密切监测患者的感染情况，避免局部皮肤破损，保持局部清洁干燥，以促进愈合。