早上起来眼睛肿痛可能是睡眠姿势不当、睑腺炎、急性结膜炎、角膜炎、肾小球肾炎等疾病导致的，这些疾病都可能导致眼部肿胀和疼痛。由于眼部肿痛可能影响视力，建议患者及时就医以确定具体原因并接受适当治疗。

1.睡眠姿势不当

睡前长时间过度用眼、熬夜等会导致眼部血液循环不畅，从而出现早上起来眼睛肿痛的情况。睡前适当按摩眼部可以促进血液循环，缓解眼部疲劳。

2.睑腺炎

睑腺炎通常由葡萄球菌尤其是金黄色葡萄球菌感染引起，炎症因子刺激局部组织，导致眼皮红肿和疼痛。若炎症向深层发展，则可形成脓肿，进而导致眼睛肿胀。患者可通过热敷的方式进行缓解，也可以遵医嘱使用抗生素药膏进行治疗，如红霉素软膏、莫匹罗星软膏等。

3.急性结膜炎

急性结膜炎多为细菌或病毒感染所致，病原体侵袭眼部黏膜会引起炎症反应，此时会出现眼睛充血、水肿等症状。如果是细菌性结膜炎，可在医生指导下使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等药物进行抗感染治疗；若是病毒性结膜炎则需遵照医生的意见选用更昔洛韦滴眼液、重组人干扰素α-2b滴眼液等具有抗病毒作用的眼部用药进行处理。

4.角膜炎

角膜炎是角膜防御能力减弱时受到外源性或内源性致病因素侵袭所引起的角膜炎症，由于炎症因子刺激角膜组织，所以会导致眼部不适。对于真菌性角膜炎，需要配合医生接受角膜移植术以去除受累组织。

5.肾小球肾炎

肾小球肾炎是由多种原因导致的肾脏免疫介导炎症，炎症细胞通过免疫复合物沉积于肾小球，使肾小球毛细血管壁发生炎性反应，表现为眼睑浮肿。患者可以在医生指导下服用氢氯噻嗪片、呋塞米片等利尿剂改善症状。

针对眼睛肿痛的症状，建议进行眼科检查，包括视力测试、裂隙灯检查以及眼压测量等，以排除其他潜在的眼部疾病。同时，应保持充足的休息，避免过度用眼，保证良好的睡眠质量。