肛门起肉疙瘩并疼痛可能是痔核脱出、肛裂等原因导致的，需要及时处理。

痔核脱出是指肛门内的静脉曲张团块随着排便而突出到肛门外，引起肛门不适和疼痛；肛裂则是由于肛管皮肤破裂引起的，会导致肛门周围出现痛性肿块。这两种情况都需要医生的专业诊断和治疗，因此应尽快就医以便获得适当的治疗。

此外，还可能与血栓性外痔、直肠息肉等疾病有关。这些疾病都可能导致肛门部位出现异常组织增生或血液循环障碍，从而形成肉疙瘩并引发疼痛。

患者平时应注意保持肛门卫生，避免久坐、便秘等情况发生，以减少肛门疾病的发病率。同时，在发现肛门异常症状时应及时就医，以便早期发现和治疗相关疾病。