扁桃体炎一般不会直接导致肾囊肿的发生，但若患者存在慢性扁桃体炎且伴有反复发作的情况，则有可能会导致肾囊肿的发生。

扁桃体炎主要是由于病原体入侵所诱发的一种疾病，此时患者的免疫力比较低下，如果未及时接受规范有效的治疗措施，使病情持续发展，则容易增加肾脏疾病的发病几率。肾囊肿是一种良性病变，其形成可能与外伤、遗传因素等有关，这些因素并不会直接导致肾囊肿的发生，但是会使患病概率增加。

肾囊肿还可能是由先天性发育异常引起，如多囊肾或髓质海绵肾，这些疾病也可能伴随尿路感染，进而出现类似症状。此外，长期使用某些药物，如非那西汀、环磷酰胺等，也可能会损伤肾组织，从而增加肾囊肿的风险。

在临床上，对于患有扁桃体炎的患者，应避免过度劳累以及熬夜，并且还要注意饮食调理，尽量以清淡易消化的食物为主，比如小米粥、蔬菜粥等，有利于身体恢复。