病毒性结膜炎与细菌性结膜炎的区别在于病因不同，前者由特定病毒感染引起，后者则由革兰氏阳性或阴性细菌感染所致。
病毒性结膜炎主要是由于特定的病毒感染所诱发的结膜炎症，常见的包括腺病毒、肠道病毒等，此时需要针对特定的抗病毒药物进行针对性治疗。而细菌性结膜炎则是由革兰氏阳性或阴
性细菌感染所引起的结膜炎症，此时需要选用适当的抗生素类药物进行治疗。
此外，真菌性结膜炎也需考虑在内，可通过实验室检查确诊，通常需要使用抗真菌眼药水进行治疗。
无论是哪种类型的结膜炎，都应强调保持眼部卫生，并避免接触可能的传染源以减少交叉感染的风险。同时，在诊断明确后，患者应及时就医接受专业治疗，以免病情加重或导致并发症的发生。
