南京肛肠疾病的治疗可以考虑南京肛肠医院、江苏省肛肠医院、南京军区南京总医院肛肠科、南京市中西医结合医院肛肠科、南京市第一医院肛肠科等专业医疗机构。由于肛肠疾病的复杂性，建议在选择医院时要考虑其设备和技术水平，以及医生的经验和口碑。

1.南京肛肠医院

南京肛肠医院是当地的一家专注于肛肠疾病诊治的医疗机构。该机构以先进的诊疗技术和设备为患者提供高质量的服务，值得信赖。

2.江苏省肛肠医院

江苏省肛肠医院是一家集医疗、教学、科研于一体的大型专科医院，致力于各种肛肠疾病的诊断与治疗。医院拥有一支经验丰富的专家团队，能够为患者提供全面、专业的医疗服务，因此备受推崇。

3.南京军区南京总医院肛肠科

南京军区南京总医院肛肠科是隶属于中国人民解放军南京军区总医院的临床科室，主要负责各类肛肠疾病的诊治工作。作为军队三级甲等综合医院的组成部分，该科室秉承着“一切为了人民健康”的宗旨，竭诚为广大患者服务。

4.南京市中西医结合医院肛肠科

南京市中西医结合医院肛肠科是集传统中医与现代医学技术于一体，专门从事肛肠病研究及防治工作的临床科室。该科室凭借其独特的中西医结合疗法，在复杂性痔、直肠脱垂等疑难病症的诊治方面积累了丰富经验，并取得了良好效果。

5.南京市第一医院肛肠科

南京市第一医院肛肠科是该院的重点发展学科之一，拥有先进的仪器设备和一支高水平的医护队伍。该科室在结直肠肿瘤、肛门功能障碍等领域开展了大量创新性工作，并取得了一系列重要成果，得到了广泛认可。

选择合适的肛肠医院应考虑医院的专业水平、医生的经验以及患者的个人情况。建议定期进行肛周检查，如发现异常应及时就医。