做胆总管囊肿手术的风险，主要包括术后出血、感染、胆瘘、胰瘘、出血性胆管炎等。建议患者及时到医院完善术前相关检查，如血常规、肝功能、凝血功能、心电图等，并积极配合医生进行治疗，以降低手术的风险。

1、术后出血：术中囊肿切除过多，可导致胆总管断端残留，从而引起出血，多表现为术后胆管断端的活动性出血;

2、感染：如吻合口瘘，多是由于局部出现了愈合不良的情况，如出现了组织坏死或者是出现了细菌感染，在手术过程中，如果操作不当就可能会导致感染，从而引起腹腔感染;

3、胆瘘：多是在吻合口处出现了破裂，而导致胆汁直接进入腹腔，从而引起腹腔感染，严重时还可能会导致全身感染，出现败血症等情况;

4、胰瘘：如果在做胆总管囊肿手术的过程中，由于操作不当，损伤了胰管，就可能会导致胰瘘，主要表现为胰液从破裂的部位流出，而不流出肠腔;

5、出血性胆管炎：如果在做胆总管囊肿手术的过程中，由于结扎的不紧密，或者是患者的凝血功能出现障碍，就可能会导致出血性胆管炎。

此外，还可能出现麻醉的风险，如术后苏醒延迟、术后苏醒困难、术后苏醒时间延长等，还可能出现肠梗阻、腹腔感染等情况。虽然胆总管囊肿手术的风险比较多，但随着医疗技术的发展，出现的风险也在逐渐减少，患者无需过度担心，建议积极配合医生进行治疗，以降低出现风险的几率。